L'independance de la Croatie a ete proclamee en 1990 et une equipe nationale de football a ete mise en place presque simultanement. Cette equipe a celebre son nouveau statut en jouant son premier match contre les Etats-Unis en octobre de la meme annee. En 1992, l'admission de l'equipe de Stanko Poklepovic a la FIFA marque une etape importante dans l'evolution du football au sein de la nouvelle republique.

Les premiers matchs de la Croatie en tant que nation officielle de football, avec son maillot a damier rouge et blanc, ont eu lieu lors d'une tournee en Australie. Les Croates ont marque l'Euro 96 par leur presence, ce qui n'est pas surprenant si l'on considere l'etendue des talents disponibles lors de la selection, et ce, des les premiers jours de l'evenement. Des joueurs comme Robert Jarni, Robert Prosinecki, Davor Suker et Zvonimir Boban etaient des stars internationales confirmees de la Yougoslavie qui defendaient desormais les couleurs de leur pays natal, la Croatie. Ces joueurs de renom etaient completes par une nouvelle et remarquable generation de talents emergents comme Slaven Bilic, Alen Boksic et Dario Simic.