Hoop was hooggespannen bij Craven Cottage dat het seizoen 1999/00 een push zou brengen voor promotie naar de Premier League.

Het team van Paul Bracewell begon sterk aan de campagne met een reeks van 15 wedstrijden ongeslagen in alle competities, maar een moeizame periode met zeer weinig overwinningen aan het einde van het kalenderjaar beperkte de kansen van het team.

Bracewell vertrok in maart, en onder interim-managers Karl-Heinz Riedle en Roy Evans eindigde de club uiteindelijk op de 9e plaats, gehinderd door het ontbreken van een constante doelpuntenmaker. Middenvelder Lee Clark stond bovenaan de topscorerslijst met slechts acht doelpunten.